El Xeneize se enfrentó en 16 ocasiones con equipos santiagueños y obtuvo 12 victorias.
Güemes es el rival de Boca en los 32avos de Final de la Copa Argentina 2015-2016. Los antecedentes entre el Xeneize y los representantes de Santiago del Estero son 16 y dos de ellos pertenecen a la edición 1969 del certamen integrador, en el que el conjunto de Primera División eliminó a Sarmiento. No se registran cruces desde 1978, cuando Mitre fue el rival tres días antes de la Final del Mundial de aquel año en un amistoso.
Para obtener la Copa Argentina 1969, Boca inició su camino en 16avos de Final con una victoria ante Atlético Tucumán. En Octavos, su adversario fue Sarmiento, rival al que venció por 3-1 y 4-2 para lograr una nueva clasificación y seguir adelante en un camino que terminaría en consagración frente a Atlanta. Dos años antes, había tenido su primer encuentro oficial contra un club de la provincia, al perder 2-1 como local con Central Córdoba por el Torneo Nacional. En 1971, el Xeneize volvió a jugar ante el mismo conjunto y cosechó el único empate en el historial general.
El primer partido que Boca disputó ante un equipo santiagueño se dio el 27 de mayo de 1926 ante un combinado de Santiago del Estero llamado Liga Cultural. Con la victoria por 3-0 en condición de visitante, el Xeneize iniciaría una serie de victorias ante el mismo adversario que se mantuvo hasta 1957, cuando fue sorprendido por 1-0 en otro amistoso. En el medio, se dieron otros dos cruces ante el Club Santiago y contra un combinado de la localidad, en los que el conjunto de La Ribera también cantó victoria.
Güemes enfrentó al Xeneize en una sola oportunidad. Fue el 30 de mayo de 1977 y el conjunto de La Ribera se impuso por 4-1 con los tantos de Daniel Pavón, Mario Zanabria y Carlos Ortiz en dos oportunidades (descuento de Cerusico para el perdedor). En aquel encuentro, el equipo dirigido en ese entonces por Juan Carlos Lorenzo formó con Héctor Pistone; José María Suárez, Francisco Sá, Roberto Mouzo, Mario Carballo; Carlos Veglio, Ruben Suñé, Jorge Ribolzi; Carlos Ortiz, Daniel Pavón y Mario Zanabria.
Todos los antecedentes de cruces entre Boca y equipos santiagueños
Amistoso, 27/5/1926: Liga Cultural 0 – Boca 3
Amistoso, 29/5/1928: Santiago 0 – Boca 3
Amistoso, 8/6/1938: Liga Cultural 0 – Boca 2
Amistoso, 8/5/1951: Liga Cultural 1 – Boca 3
Amistoso, 10/7/1955: Liga Cultural 1 – Boca 2
Amistoso, 5/9/1957: Liga Cultural 1 – Boca 0
Amistoso, 28/8/1965: Combinado de Santiago 1 – Boca 2
Amistoso, 15/6/1966: Boca 5 – Liga Cultural 1
Amistoso, 9/7/1966: Liga Cultural 3 – Boca 2
Torneo Nacional, 15/10/1967: Boca 1 – Central Córdoba 2
Copa Argentina, 12/2/1969: Sarmiento 1 – Boca 3
Copa Argentina, 14/2/1969: Sarmiento 2 – Boca 4
Torneo Nacional, 30/10/1971: Central Córdoba 1 – Boca 1
Amistoso, 6/6/1974: Central Córdoba 0 – Boca 4
Amistoso, 30/5/1977: Güemes 1 – Boca 4
Amistoso, 22/6/1978: Mitre 2 – Boca 5
Fuente: Copa Argentina